La Alcaldía es una Entidad del Estado, creada constitucionalmente, cuyo alcalde es elegido mediante voto popular, quien tiene la condición de servidor público. Está conformada por varias dependencias e institutos descentralizados que tienen como principal objetivo cumplir variadas funciones enfocadas al beneficio de la comunidad brindando servicios de manera oportuna, eficaz, con calidad y honestidad para el mejoramiento de la ciudad y el bienestar de los habitantes.

En Zipaquirá para el período 2016 – 2019 fue elegido como alcalde, por voto popular, Luis Alfonso Rodríguez Valbuena. Zipaquirá nuestra ¡un gobierno bonito!.